GBS 기반 형질관련 마커 개발

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작성자 최고관리자 댓글 0건 조회 259회 작성일 22-11-15 17:35

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GBS 기반 형질관련 마커 개발

(GWAS, QTL-mapping 분석)

 

Population genetic analysis workflow

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GWAS 분석

 

•GWAS는  유전자원을 대상으로 형질관련 유전자 부위를 추적하는 분석 기법

•GWAS(Genome-wide association study) 는 분석하고자 하는 생물체의 target 형질과 연관성 있는 유전자의 위치를 유전체 전반에 걸쳐 분석 

 

QTL mapping 분석 사례

 

• QTL mapping은 주로 교배자원 (F2)를 대상으로 형질관련 유전자 부위를 추적하는 분석 기법
• 키, 꽃 색 과 같은 양적 형질은 여러 유전자가 복합적으로 관여하는데, 이 유전자의 영역을 양적 유전자좌 (Quantitative Trait Loci; QTLs)라고 지칭
• Recombination frequency 등의 통계분석을 수행하여 연관지도(linkage map) 를 작성함. 작성된 연관지도와 특정 형질의 표현형 값을 이용하여 QTL 영역을 탐색

*형질 관련 마커 선발용 GWAS 분석

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*Target 형질분포도(histogram) 및 형질 상관관계(correlation plot) 분석
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*형질연관 QTL 영역 분석 및 SNP 마커발굴

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*F2 교배집단을 대상으로 연관군(Linkage group) 작성 및 양적 형질 관련 마커 선발을 위한 QTL mapping 

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